El Senador Manuel Cepeda fue asesinado por un operativo conjunto entre agentes de la fuerza pública y paramilitares, organizado desde el Estado, el 9 de agosto de 1994. Fue uno de los más de cien cargos públicos y cuatro mil militantes de la Unión Patriótica exterminados entre 1986 y 1994. El Estado colombiano fue condenado por la Corte Interamericana de Derechos Humanos y pidió públicamente perdón por el asesinato del senador, militante del Partido Comunista y de la Unión Patriótica.
El general en retiro Jaime Ruíz Barrera, presidente de la Asociación Colombiana de Oficiales en Retiro, Acore, dijo este 16 de mayo en la Cámara de Representantes que «entre quienes atacan el fuero militar hay un hijo de un exguerrillero«, aludiendo a Iván Cepeda. Iván Cepeda respondió con severidad: «usted no respeta a las víctimas de este país, avala los crímenes de lesa humanidad, le voy a entablar una denuncia penal ¿Usted respeta en general a alguien? Quien representó a la Nación no puede hablar así de sus contradictores».
Ante el anuncio de la denuncia, el general (r) le respondió: «vamos a los tribunales y vamos a donde usted quiera. No soy cobarde como usted lo dijo. Hágalo con prontitud, no me siga amenazando y actúe».
«Proceda como un varón. Muchas gracias y le agradezco su anuncio. Estoy temblando de miedo», agregó.
Cepeda además manifestó que Ruiz no respeta a las víctimas de este país y que «no tiembla de miedo para justificar crímenes». «Usted cree que mi padre fue bien muerto, que le dieron de baja justificadamente», aseveró el congresista.